综合管理部：主要负责协会文秘、机要、保密、保卫、信访；会议组织；对外联络、协调；协会文件资料收发和档案管理；对外宣传；网络管理；信息资料收集、整理、发布；起草行业管理综合性法规、制度及有关报告、文件；行业发展理论和政策调查研究，为领导决策提供服务；行业刊物编辑、出版、发行等。
行政管理部：主要负责协会会费收缴和核算；协会秘书处会计核算及财务管理；协会秘书处工资和人事管理；协会秘书处职工福利和职工奖励管理；行政后勤管理；实物资产管理；检查、监督、指导会计师事务所、资产评估机构的财务会计工作等。
自律监管部：主要负责会计执业活动的日常业务监管；对违反行业管理规定执业的中介机构及执业人员给以行业惩戒；会计师职业道德、执业准则、专业标准、行业管理规范研究、解释和贯彻实施等。
考试培训管理部：主要负责组织会计及相关执业资格工作；实施执业资格制度和办法；组织会计及其执业人员后续教育培训；制定培训制度和计划；授课教师的组织与管理；组织编辑相关培训教材等。
会员管理部：主要负责个人会计会员及团体会员的登记等。
